Reserva Santa Fe se localiza en medio de una de las comunidades biológicas más importantes del centro del país, enclavada dentro del Parque Estatal Santuario del Agua y Forestal Subcuenca Tributaria Río San Lorenzo, y cuyos macizos forestales dan cabida a una inmensa riqueza biológica que se destaca, entre muchas cosas, por su alto número de endemismos y por la cantidad de servicios ambientales que prestan al Valle de México.Contamos con 270 especies de hongos, 31 especies de árboles, 20 de mamíferos, 93 de aves y 19 de reptiles y anfibios. La especie dominante del bosque de Reserva Santa Fe, es el Abies religiosa, comúnmente conocido como oyamel, quien recibe su nombre gracias a que las hojas en la punta de sus ramas forman una cruz.